Szerves anyagok:

Díszhalaink és növényeink a természetben egy összefüggő és önfenntartó nagy tápláléklánc részei. A temelő szervezetek (növények), képesek fenntartani magukat a szervetlen anyagokból. A növények természetes táplálékai a növényevő állatok. Később ezek táplálják a halakat és más ragadozó élőlényeket. A tápláléklánc végén, a lebontók minden bomlásnak indult hulladékot, újra szervetlen anyaggá alakítanak. Ezeket újra felhasználják a növények és folyamatossá válik a táplálék körforgás. A rendszer nem önfenntartó. Az akváriumokban a korlátozott tér és a zsúfoltság miatt, minden betelepített élőlényről nekünk kell gondoskodnunk.
Szűrőrendszerek és növények segítségével kell tisztítanunk a vizet, lebontanunk a káros anyagokat.
Szerves anyagok lebomlásával a legnagyobb mennyiségben képződő hulladék a nitrogén. Szintjének mérése fontos. Jó növényesítéssel, hatékony szűréssel és rendszeres részleges vízcserékekkel megfelelő szinten tartható. Az algásodás és a halak megváltozott viselkedése, felhívja a figyelmet, ha baj van. Ilyen esetben részleges vízcsere és szűrők tisztítása után, meg kell találnunk a probléma okát, azt a helyet ahol a hulladék felhalmozódhat (túltelepített akváriumok esetében adott a probléma oka).
A háttérben a nitrát feldúsulása áll. Salakanyagok, táplálékmaradványok, elhalt növényi részek, karbamid, fehérje lebomlásából keletkezik a nitrogén körforgás első káros anyaga, az ammónium NH3 illetve az ammónia NH4. Ez rendkívül mérgező minden élőlényre! Fontos a megfelelő szűrőanyagok biztosítás, mivel ezek felületén el fognak szaporodni a lebontó baktériumok.
Az ammónia bomlása során Nitrosomonas baktériumok az oxigént nitritté NO2 alakítják, végül a Nitrobacter baktériumok alakítják nitráttá NO3 az oxigént és a nitritet.
A nitrát tatalom tovább már nem bomlik, így felhalmozódik az akváriumban és a szűrőben. Nagy koncentrációban a nitrát (50mg/l-től) káros a halállományra és a növényekre. Az algásodás oka a hulladékok, a nitrát felhalmozódása. Savak és más káros hulladékok keletkeznek minden szerves anyag bomlásakor, melyek sárgára színezik a vizet. A szűrőanyagok tisztításával, gyorsan növekvő növényzet telepítésével és részleges vízcserével csökkenthetjük a felhalmozódott nitrátot.
Szűrőrendszerben mechanikai és biológiai tisztítási folyamatokon keresztül szabadulhatunk meg a káros anyagoktól. Mechaniaki úton a „nagyobb” látható hulladékokat távolíthatjuk el. Biológiai szűrés esetén fontos az aerob és anaerob baktériumok életterének biztosítása porózus szerkezetű szűrőanyagokkal (Siporax).
Az akváriumba telepített növényzet természetes nitrátfelhasználást szolgál, ügyeljük a kellő mennyiségű növény telepítésére.